为疫情提供精准溯源
连日来,在市疾控中心基因测序实验室,严炳清博士和同事们一天也没有休息,一直忙着为阳性核酸标本进行基因测序。
2月15日,我市在外地返通人员核酸检测中,发现1人检测结果呈阳性,这也是今年南通发现的首个阳性病例。疫情一触即发,市疾控中心新冠病毒基因测序实验室第一时间行动起来,对该病例的核酸样本进行了基因测序。“我们的测序结果与省疾控中心进行了比对,结果完全一致,这标志着我市新冠病毒基因测序技术已经成熟。”市疾控中心微生物检验科科长熊海平介绍,自我市本轮疫情发生后,该实验室就持续对新发现的新冠病毒阳性核酸样本进行基因测序,及时向上级有关部门提交数据分析报告,为疫情溯源、风险研判提供了有力支撑。
如果把流调溯源比作侦探在蛛丝马迹中寻找线索,那么病毒基因测序则是为“侦探”提供“实锤”的证据,从病原学的角度更准确地认定病毒的来源。“基因测序技术可在第一时间获取新冠病毒的全基因组序列信息,通过序列比对,分析新冠病毒的进化及变异情况,为疫情精准溯源提供技术支持,为控制新冠肺炎疫情提供科学依据。”熊海平介绍,基因测序的优势在于能够准确锁定在一地流行的是新冠病毒的哪个“分支”。他举例说,两个感染者的核酸检测均为阳性,但是他们有可能携带的是不同型别的毒株,只有通过基因测序确定感染病毒类型,才能及时研判疫情、采取有针对性的防控措施。记者了解到,在流调工作中,对于已经确定感染源的病例,可以通过基因测序这一“金标准”进行佐证,找不到感染源的病例则能够通过基因测序的结果进行反推溯源。
31岁的严炳清是去年7月市疾控中心从哈尔滨医科大学病原生物学专业引进的高端人才,疫情发生以来,他几乎不分昼夜地忙碌在实验室。“核酸检测分析的是新冠病毒的特征片段,而核酸测序分析的是新冠病毒的全基因组,操作步骤更为复杂,耗时更长。”严炳清介绍,从样品进入实验室到下机进行数据分析,就要30多个小时。只要阳性标本一送来,他和团队成员就马上进入实验室工作,“每次拿到阳性标本进入实验室的那一刻,就深切地感受到疫情就在身边、就在我的手中,心中的使命感和责任感也油然而生。”
严格把控检测质量
市三院近期平均每天完成的核酸采样量在3000多人次。采样标本激增,检验科医务人员“连轴转”,优化检测流程、增加检测批次,力争以最快的速度出结果。“核酸检测从早上6点半开始,到凌晨一两点结束。为提高检测效率,每批人员连续工作6个多小时。”检验科主任陆仁飞介绍,目前,三院承担了崇川区、苏锡通产业园区及其他地区部分检测工作,每天核酸检测量达到了5000多管。
作为新冠肺炎病患省级定点收治医院,三院检验科还需对相关患者进行多轮检测,给治疗及能否达到出院标准提供及时准确的参考。“这部分样本的病毒载量很高,我们对该类样本采用3种不同的试剂复核,工作量相当于翻了三番。”检验科主任陆仁飞说。
作为市“黄码”定点收治医院,市二院第一时间优化核酸采集点等重要点位工作流程,全力保障核酸采样工作有序开展。目前,医院先后设置并启用院外北门绿码人员便民核酸采样点、院内住院病人核酸采样点和绿码带星人员核酸采样点以及发热门诊就诊人员核酸采样点,彻底解决核酸采样的“最后一公里”问题。
为全面提升核酸检测能力,二院加急采购核酸检测物资设备。随着核酸检测的需求大量增加,连日来,该院检验科8名检测人员24小时轮班守候,全力以赴,快速精准完成核酸检测任务。
南通瑞慈医院检验科PCR实验室同样处在满负荷工作状态。作为市开发区唯一的三级综合性医院,医院陆续承担了开发区隔离点、47所学校、小海街道封控及管控区的核酸检测任务。“我们医院的PCR实验室通过了省级实验室验收,检测人员都取得了江苏省临床基因扩增检验技术人员上岗证书。” 瑞慈医院检验科刘春霞主任介绍,在严格按照规范要求采购灵敏度高、质量可靠的试剂之外,为了保证检验结果的准确性,该院检验科每批次样本都会进行室内质控。
8个应急检测基地启用
“随着我市疫情防控措施动态升级调整,我们相关检测基地的压力也骤增,检测人员都是轮班24小时不间断作业。”7日,在市应急核酸检测基地,忙着调配人手、安排检测工作的南通市第一人民医院检验科主任曹兴建告诉记者。
核酸检测对及时发现新冠病毒感染者、防止疫情扩散具有重要作用。我市高度重视、持续推进检测能力建设。目前,全市共建有8个核酸检测基地,临时抽调350名核酸检测人员,24小时检测能力20万管,设计最大检测能力30万管。此外,基地每天预留5万管检测能力接受上海标本。8个基地中,检测能力最大的是启东核酸检测基地,日检测量最高可达5万管。除此以外,加上我市各家医院和各检测机构的检测能力,本次疫情发生以来,全市核酸检测队员持续加班加点,日单管检测能力保持在40万管,为疫情防控作出了重要贡献。
“现在制约我们的主要是检测人员不足的问题,目前只能通过延长检测人员的工作时间来弥补。”曹兴建表示。
本报记者冯启榕 李波 俞鑫城
